怀疑妻子出轨时，申请查微信聊天记录需要遵循合法途径，以下是几种合法的查询方式：

1. 与配偶沟通：在怀疑的初期，建议先与配偶进行坦诚的沟通，直接询问对方的行为和想法，或许能够澄清误会。

2. 查阅共同财产记录：如果与配偶共同管理财务，可以通过查看共同财产的相关信息，判断配偶是否有异常行为，例如频繁的支出记录、特定时间的消费信息等。

3. 委托律师调查：通过委托专业人士进行合法的调查，可以获取更为严谨和有效的证据。在调查过程中，专业人士会遵循法律规定，确保信息收集的合法性。

4. 申请法院调取证据：如果已经在法律层面提起了离婚诉讼，可以申请法院调取相关证据。在诉讼中，法院有权要求对方提供相关的聊天记录，尤其是涉及到抚养权、财产分割等问题时。

需要注意的是，未经同意擅自获取他人通讯内容可能涉及侵犯隐私，建议寻求专业法律意见，确保遵循相关法律法规。此外，收集的证据必须是合法获得的，以确保在后续的法律程序中具备证据的有效性。

综上所述，怀疑妻子出轨时，应通过合法途径获取微信聊天记录，避免采取私自截取、入侵他人账户等违法行为。如果无法自行解决问题，建议寻求专业律师或心理咨询师的帮助，以获取更具体的法律建议和心理支持。